8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78678
Cell Name :  CA1-cell-3_1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  CA1-cell-3_1.pvec
Note :  Glutamine synthetase staining

Reference Article
Related Article Reference :  Redistribution of astrocytic glutamine synthetase in the hippocampus of chronic epileptic rats.

Measurements
Soma Surface :  365.56 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  15
Overall Width :  52.55 μm
Overall Height :  37.22 μm
Overall Depth :  6.92 μm
Average Diameter :  0.44 μm
Total Length :  259.58 μm
Total Surface :  409.44 μm2
Total Volume :  68.74 μm3
Max Euclidean Distance :  35.85 μm
Max Path Distance :  64.98 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  235
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  0.56
Average Bifurcation Angle Local :  88.62°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.02°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website