8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59750
Cell Name :  C9---Young-KO
Archive Name :  Lambe
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chrna5 knockout
Staining Method :  neurobiotin, Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-02
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  C9---Young-KO.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Nicotinic alpha5 subunits drive developmental changes in the activation and morphology of prefrontal cortex layer VI neurons.

Measurements
Soma Surface :  457.81 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  40
Overall Width :  209.01 μm
Overall Height :  899.78 μm
Overall Depth :  86.93 μm
Average Diameter :  1.23 μm
Total Length :  3932.69 μm
Total Surface :  15453.7 μm2
Total Volume :  5191.47 μm3
Max Euclidean Distance :  736.6 μm
Max Path Distance :  833.96 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  2044
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  50.2°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.75°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website