8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59828
Cell Name :  C3---Young-KO-Con
Archive Name :  Lambe
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chrna5 knockout
Staining Method :  neurobiotin, Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-02
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  C3---Young-KO-Con.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chrna5 genotype determines the long-lasting effects of developmental in vivo nicotine exposure on prefrontal attention circuitry.

Measurements
Soma Surface :  610.14 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  27
Overall Width :  285.44 μm
Overall Height :  636.65 μm
Overall Depth :  93.94 μm
Average Diameter :  1.08 μm
Total Length :  2282.62 μm
Total Surface :  7820.75 μm2
Total Volume :  2352.19 μm3
Max Euclidean Distance :  466.1 μm
Max Path Distance :  497.02 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1171
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.82
Average Bifurcation Angle Local :  43.88°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.94°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website