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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59779
Cell Name :  C2---Adult-KO-Nic
Archive Name :  Lambe
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chrna5 knockout
Staining Method :  neurobiotin, Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-02
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  C2---Adult-KO-Nic.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chrna5 genotype determines the long-lasting effects of developmental in vivo nicotine exposure on prefrontal attention circuitry.

Measurements
Soma Surface :  406.95 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  55
Overall Width :  299.08 μm
Overall Height :  522.49 μm
Overall Depth :  159.18 μm
Average Diameter :  1.05 μm
Total Length :  4002.23 μm
Total Surface :  13452.1 μm2
Total Volume :  3844.29 μm3
Max Euclidean Distance :  529.5 μm
Max Path Distance :  586.72 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1946
Partition Asymmetry :  0.35
Average Rall's Ratio :  2.14
Average Bifurcation Angle Local :  57.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.2°
Fractal Dimension :  1.03

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