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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59715
Cell Name :  C12---Adult-KO
Archive Name :  Lambe
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chrna5 knockout
Staining Method :  neurobiotin, Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-02
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  C12---Adult-KO.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Nicotinic alpha5 subunits drive developmental changes in the activation and morphology of prefrontal cortex layer VI neurons.

Measurements
Soma Surface :  334.4 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  45
Overall Width :  240.61 μm
Overall Height :  725.81 μm
Overall Depth :  95.47 μm
Average Diameter :  1.18 μm
Total Length :  3958.94 μm
Total Surface :  14987.3 μm2
Total Volume :  4981.1 μm3
Max Euclidean Distance :  698.92 μm
Max Path Distance :  766.23 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  2001
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.09
Average Bifurcation Angle Local :  51.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.4°
Fractal Dimension :  1.03

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