8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296875
Cell Name :  C1-20210616_C03_00001_recon_v2
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  29.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  C1-20210616_C03_00001_recon_v2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  291.96 μm2
Number of Stems :  17
Number of Bifurcations :  127
Number of Branches :  271
Overall Width :  59.34 μm
Overall Height :  48.16 μm
Overall Depth :  8.48 μm
Average Diameter :  0.73 μm
Total Length :  1642.87 μm
Total Surface :  3978.94 μm2
Total Volume :  849.21 μm3
Max Euclidean Distance :  40.35 μm
Max Path Distance :  48.09 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1040
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.81
Average Bifurcation Angle Local :  84.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.85°
Fractal Dimension :  1.04

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