8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296877
Cell Name :  C1-20210506_C01_00001_recon_draft
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  11.0 days
Max Age :  11.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  C1-20210506_C01_00001_recon_draft.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  211.66 μm2
Number of Stems :  14
Number of Bifurcations :  450
Number of Branches :  914
Overall Width :  77.07 μm
Overall Height :  56.75 μm
Overall Depth :  8.92 μm
Average Diameter :  0.66 μm
Total Length :  4251.92 μm
Total Surface :  9394.16 μm2
Total Volume :  1865.33 μm3
Max Euclidean Distance :  82.72 μm
Max Path Distance :  91.87 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  3263
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  77.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.43°
Fractal Dimension :  1.05

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