8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296903
Cell Name :  C1-20210504_C05_00001_recon_v2
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  C1-20210504_C05_00001_recon_v2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  433.06 μm2
Number of Stems :  17
Number of Bifurcations :  141
Number of Branches :  299
Overall Width :  51.94 μm
Overall Height :  50.29 μm
Overall Depth :  9.17 μm
Average Diameter :  1.01 μm
Total Length :  1781.79 μm
Total Surface :  6244.75 μm2
Total Volume :  2801.29 μm3
Max Euclidean Distance :  40.27 μm
Max Path Distance :  62.59 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1609
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.9
Average Bifurcation Angle Local :  74.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.8°
Fractal Dimension :  1.03

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