8.6.88 - Released: 2025-08-26 - Content: 278255 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07761
Cell Name :  C060311B-1-SR
Archive Name :  Markram
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  36.0 days
Max Age :  36.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  157.2 grams
Max Weight :  157.2 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  Not reported
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected 125% in z
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-12-20
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  C060311B-1-SR.pvec
Note :  Neuron from right hemisphere

Reference Article
Related Article Reference :  Models of neocortical layer 5b pyramidal cells capturing a wide range of dendritic and perisomatic active properties

Measurements
Soma Surface :  1142.64 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  92
Number of Branches :  194
Overall Width :  286.77 μm
Overall Height :  1290.65 μm
Overall Depth :  139.99 μm
Average Diameter :  0.7 μm
Total Length :  12726.8 μm
Total Surface :  30413.9 μm2
Total Volume :  10122.79 μm3
Max Euclidean Distance :  1179.89 μm
Max Path Distance :  1309.27 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  4068
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  82.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.98°
Fractal Dimension :  1.04

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