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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_80560
Cell Name :  C-MSN-1
Archive Name :  Anderson
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-22
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  C-MSN-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of the neurodevelopmental gene Zswim6 alters striatal morphology and motor regulation.

Measurements
Soma Surface :  578.78 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  37
Overall Width :  147.43 μm
Overall Height :  250.98 μm
Overall Depth :  72.42 μm
Average Diameter :  1.21 μm
Total Length :  1817.5 μm
Total Surface :  6952.11 μm2
Total Volume :  2123.32 μm3
Max Euclidean Distance :  151.73 μm
Max Path Distance :  197.68 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  408
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  72.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.54°
Fractal Dimension :  1.05

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