8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283386
Cell Name :  Bambi-Section-1_1-Reconstruction-2
Archive Name :  H_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 InsG3680+/+;B6.Cg-Tg(Thy1-YFP)HJrs/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Shank3 knockin
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-17
Date of Upload :  2024-07-10
Persistence Vector :  Bambi-Section-1_1-Reconstruction-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  SHANK3 Mutations Associated with Autism and Schizophrenia Lead to Shared and Distinct Changes in Dendritic Spine Dynamics in the Developing Mouse Brain.

Measurements
Soma Surface :  2520.31 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  31
Overall Width :  416.49 μm
Overall Height :  816.22 μm
Overall Depth :  68.22 μm
Average Diameter :  2.74 μm
Total Length :  3695.69 μm
Total Surface :  32904.5 μm2
Total Volume :  26500.5 μm3
Max Euclidean Distance :  709.84 μm
Max Path Distance :  718.77 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  224
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  1.47
Average Bifurcation Angle Local :  55.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.25°
Fractal Dimension :  1.01

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