8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10768
Cell Name :  Badea2011Fig2Dp
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Brn3a-expression
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Reported 25%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2012-03-02
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  Badea2011Fig2Dp.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphologies of mouse retinal ganglion cells expressing transcription factors Brn3a, Brn3b, and Brn3c: analysis of wild type and mutant cells using genetically-directed sparse labeling.

Measurements
Soma Surface :  333.14 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  79
Number of Branches :  160
Overall Width :  268.89 μm
Overall Height :  592.66 μm
Overall Depth :  96.86 μm
Average Diameter :  3.16 μm
Total Length :  6504.33 μm
Total Surface :  67447.2 μm2
Total Volume :  69529.89 μm3
Max Euclidean Distance :  392.99 μm
Max Path Distance :  474.87 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1801
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  84.49°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.93°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website