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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10742
Cell Name :  Badea2011Fig2Cd
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Brn3b-expression
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Reported 25%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2012-03-02
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  Badea2011Fig2Cd.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphologies of mouse retinal ganglion cells expressing transcription factors Brn3a, Brn3b, and Brn3c: analysis of wild type and mutant cells using genetically-directed sparse labeling.

Measurements
Soma Surface :  817.49 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  82
Number of Branches :  166
Overall Width :  158.6 μm
Overall Height :  579.78 μm
Overall Depth :  81.25 μm
Average Diameter :  3.04 μm
Total Length :  4872.1 μm
Total Surface :  47959.7 μm2
Total Volume :  43857.7 μm3
Max Euclidean Distance :  364.58 μm
Max Path Distance :  463.28 μm
Max Branch Order :  23
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1370
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  3.13
Average Bifurcation Angle Local :  81.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.85°
Fractal Dimension :  1.05

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