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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10767
Cell Name :  Badea2011Fig2Ca-L
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Brn3a-expression
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Reported 25%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2012-03-02
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  Badea2011Fig2Ca-L.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphologies of mouse retinal ganglion cells expressing transcription factors Brn3a, Brn3b, and Brn3c: analysis of wild type and mutant cells using genetically-directed sparse labeling.

Measurements
Soma Surface :  274.8 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  74
Number of Branches :  150
Overall Width :  546.15 μm
Overall Height :  792.31 μm
Overall Depth :  68.72 μm
Average Diameter :  3.25 μm
Total Length :  11390.3 μm
Total Surface :  123387 μm2
Total Volume :  127400 μm3
Max Euclidean Distance :  526.42 μm
Max Path Distance :  678.21 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  2698
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.78
Average Bifurcation Angle Local :  76.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.38°
Fractal Dimension :  1.03

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