8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_32154
Cell Name :  BDLHD-V5-2-e
Archive Name :  Chen
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  350 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Bile duct ligation combining ammonia acetate (BDLHD)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  65  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-04-18
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  BDLHD-V5-2-e.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological changes of cortical pyramidal neurons in hepatic encephalopathy.

Measurements
Soma Surface :  2134.3 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  65
Number of Branches :  137
Overall Width :  248.56 μm
Overall Height :  1224.17 μm
Overall Depth :  12.25 μm
Average Diameter :  0.44 μm
Total Length :  10023.9 μm
Total Surface :  14383.9 μm2
Total Volume :  15104.2 μm3
Max Euclidean Distance :  1145.6 μm
Max Path Distance :  1223.36 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1659
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  58.51°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.22°
Fractal Dimension :  1.03

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