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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_32143
Cell Name :  BDLHD-V1-1-j
Archive Name :  Chen
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  350 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Bile duct ligation combining ammonia acetate (BDLHD)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  65  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-04-18
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  BDLHD-V1-1-j.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological changes of cortical pyramidal neurons in hepatic encephalopathy.

Measurements
Soma Surface :  1198.4 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  57
Number of Branches :  120
Overall Width :  266.5 μm
Overall Height :  1172.86 μm
Overall Depth :  17.33 μm
Average Diameter :  1.19 μm
Total Length :  8117.23 μm
Total Surface :  30199.6 μm2
Total Volume :  14117 μm3
Max Euclidean Distance :  1100.63 μm
Max Path Distance :  1185.92 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1033
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  51.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.58°
Fractal Dimension :  1.03

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