8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_32116
Cell Name :  BDL-V2-2-1-e
Archive Name :  Chen
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  350 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Bile duct ligation (BDL)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  65  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-04-18
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  BDL-V2-2-1-e.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological changes of cortical pyramidal neurons in hepatic encephalopathy.

Measurements
Soma Surface :  1265.52 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  71
Number of Branches :  147
Overall Width :  294.33 μm
Overall Height :  1254.68 μm
Overall Depth :  22.96 μm
Average Diameter :  1.2 μm
Total Length :  10190.8 μm
Total Surface :  38153 μm2
Total Volume :  17041.9 μm3
Max Euclidean Distance :  1121.3 μm
Max Path Distance :  1172.94 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  1174
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  59.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.92°
Fractal Dimension :  1.01

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