8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_32096
Cell Name :  BDL-HP1-1-E-2
Archive Name :  Chen
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  350 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Bile duct ligation (BDL)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  65  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-04-18
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  BDL-HP1-1-E-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological changes of cortical pyramidal neurons in hepatic encephalopathy.

Measurements
Soma Surface :  803.73 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  71
Number of Branches :  146
Overall Width :  266.33 μm
Overall Height :  636.78 μm
Overall Depth :  15.75 μm
Average Diameter :  1.88 μm
Total Length :  7366.6 μm
Total Surface :  43288.5 μm2
Total Volume :  23205.7 μm3
Max Euclidean Distance :  579.69 μm
Max Path Distance :  676.58 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1393
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.07
Average Bifurcation Angle Local :  50.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  44.6°
Fractal Dimension :  1.04

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