8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77733
Cell Name :  BC1_1
Archive Name :  Lien
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  0.8 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  65 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, ventral
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  Fast-spiking
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2017-04-20
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  BC1_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Causal Evidence for the Role of Specific GABAergic Interneuron Types in Entorhinal Recruitment of Dentate Granule Cells.

Measurements
Soma Surface :  2760.45 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  344
Number of Branches :  694
Overall Width :  1176.09 μm
Overall Height :  789.82 μm
Overall Depth :  139 μm
Average Diameter :  3.46 μm
Total Length :  50238.1 μm
Total Surface :  550450 μm2
Total Volume :  507574 μm3
Max Euclidean Distance :  772.09 μm
Max Path Distance :  1715.2 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  3131
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  80.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.71°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website