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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_09389
Cell Name :  BC-2010-12-01-B-L6B-dendax
Archive Name :  Feldmeyer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 6b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  multipolar
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  thalamocortical
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected 110% in xy, 210% in z
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-11-15
Date of Upload :  2013-05-06
Persistence Vector :  BC-2010-12-01-B-L6B-dendax.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Morphology and Physiology of Excitatory Neurons in Layer 6b of the Somatosensory Rat Barrel Cortex.
Secondary Article Reference :  Improved biocytin labeling and neuronal 3D reconstruction.

Measurements
Soma Surface :  1208.57 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  130
Overall Width :  594.69 μm
Overall Height :  721.28 μm
Overall Depth :  423.3 μm
Average Diameter :  0.38 μm
Total Length :  19883.8 μm
Total Surface :  25753.8 μm2
Total Volume :  6371.23 μm3
Max Euclidean Distance :  636.69 μm
Max Path Distance :  1302.32 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  17595
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  86.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.74°
Fractal Dimension :  1.04

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