8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83314
Cell Name :  BAS2-4_1
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Environmental enrichment
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  BAS2-4_1.pvec
Note :  Only basal dendrites traced

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  24.92 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  74
Overall Width :  223.16 μm
Overall Height :  128.4 μm
Overall Depth :  116.14 μm
Average Diameter :  1.56 μm
Total Length :  3677.5 μm
Total Surface :  17841.2 μm2
Total Volume :  7191.21 μm3
Max Euclidean Distance :  176.12 μm
Max Path Distance :  208.13 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1086
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  65.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.29°
Fractal Dimension :  1.03

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