8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77428
Cell Name :  B4-CA1-L-B63x1zACR5
Archive Name :  King
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-07-13
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  B4-CA1-L-B63x1zACR5.pvec
Note :  3 hour incubation time; source confocal images: https://doi.org/10.5061/dryad.t7f64

Reference Article
Related Article Reference :  Simulated blast overpressure induces specific astrocyte injury in an ex vivo brain slice model.

Measurements
Soma Surface :  53.3 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  18
Overall Width :  5.32 μm
Overall Height :  35.26 μm
Overall Depth :  21.74 μm
Average Diameter :  0.65 μm
Total Length :  105.71 μm
Total Surface :  294.23 μm2
Total Volume :  96.43 μm3
Max Euclidean Distance :  22.88 μm
Max Path Distance :  24.47 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  166
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.1
Average Bifurcation Angle Local :  82.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.11°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website