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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_118537
Cell Name :  B2_slide3_8
Archive Name :  Urban_K
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  46.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  prelimbic, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection, glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  180  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  B2_slide3_8.pvec
Note :  5 days of repeated social stress in the resident-intruder paradigm

Reference Article
Related Article Reference :  Age- and sex-dependent impact of repeated social stress on morphology of rat prefrontal cortex pyramidal neurons.

Measurements
Soma Surface :  1047.79 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  29
Overall Width :  168.75 μm
Overall Height :  444.53 μm
Overall Depth :  42.41 μm
Average Diameter :  0.81 μm
Total Length :  2266.57 μm
Total Surface :  5423.22 μm2
Total Volume :  2062.39 μm3
Max Euclidean Distance :  409.73 μm
Max Path Distance :  522.96 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.73
Total Fragmentation :  741
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.42
Average Bifurcation Angle Local :  85.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.31°
Fractal Dimension :  1.07

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