8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_118529
Cell Name :  B2_slide2_9b
Archive Name :  Urban_K
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  46.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  prelimbic, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection, glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  180  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  B2_slide2_9b.pvec
Note :  5 days of repeated social stress in the resident-intruder paradigm

Reference Article
Related Article Reference :  Age- and sex-dependent impact of repeated social stress on morphology of rat prefrontal cortex pyramidal neurons.

Measurements
Soma Surface :  2157.49 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  43
Overall Width :  151.42 μm
Overall Height :  633.42 μm
Overall Depth :  108.39 μm
Average Diameter :  0.86 μm
Total Length :  2790.2 μm
Total Surface :  7601.24 μm2
Total Volume :  2880.63 μm3
Max Euclidean Distance :  669.23 μm
Max Path Distance :  820.65 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  1041
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.88
Average Bifurcation Angle Local :  78.62°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.34°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website