8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_118619
Cell Name :  B1_slide2_neuron2
Archive Name :  Urban_K
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  46.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  prelimbic, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection, glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  180  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  B1_slide2_neuron2.pvec
Note :  5 days of repeated social stress in the resident-intruder paradigm

Reference Article
Related Article Reference :  Age- and sex-dependent impact of repeated social stress on morphology of rat prefrontal cortex pyramidal neurons.

Measurements
Soma Surface :  1092.35 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  58
Overall Width :  132.8 μm
Overall Height :  417.05 μm
Overall Depth :  65.2 μm
Average Diameter :  1.24 μm
Total Length :  3130.77 μm
Total Surface :  11036.7 μm2
Total Volume :  5148.29 μm3
Max Euclidean Distance :  256.76 μm
Max Path Distance :  295.07 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  379
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  1.43
Average Bifurcation Angle Local :  76.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.47°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website