8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145897
Cell Name :  Agranular-Insular-Cortex-2
Archive Name :  Chen_D
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 -/-: CAMKII alpha-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  insula
Tertiary Brain Region :  agranular
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Calcium/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII)-positive
Original Format :  Imaris.imx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-14
Persistence Vector :  Agranular-Insular-Cortex-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Whole-Brain Cell-Type-Specific Sparse Neuron Labeling Method and Its Application in a Shank3 Autistic Mouse Model.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  52
Number of Branches :  105
Overall Width :  290.32 μm
Overall Height :  362.18 μm
Overall Depth :  40.46 μm
Average Diameter :  1.69 μm
Total Length :  4052.61 μm
Total Surface :  21541.9 μm2
Total Volume :  9112.24 μm3
Max Euclidean Distance :  253.08 μm
Max Path Distance :  268.96 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  7026
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  29.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.34°
Fractal Dimension :  1.02

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