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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145888
Cell Name :  Agranular-Insular-Cortex-1
Archive Name :  Chen_D
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 +/+: CAMKII alpha-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  insula
Tertiary Brain Region :  agranular
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Calcium/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII)-positive
Original Format :  Imaris.imx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-14
Persistence Vector :  Agranular-Insular-Cortex-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Whole-Brain Cell-Type-Specific Sparse Neuron Labeling Method and Its Application in a Shank3 Autistic Mouse Model.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  70
Number of Branches :  141
Overall Width :  228.82 μm
Overall Height :  357.26 μm
Overall Depth :  34.3 μm
Average Diameter :  1.86 μm
Total Length :  5128.72 μm
Total Surface :  30017.3 μm2
Total Volume :  13980.6 μm3
Max Euclidean Distance :  231.58 μm
Max Path Distance :  252.38 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  8037
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  33.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.88°
Fractal Dimension :  1.01

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