8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_116558
Cell Name :  A_RFP_0002_final
Archive Name :  Firestein
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuronJ.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-12-02
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  A_RFP_0002_final.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Overexpression of cypin alters dendrite morphology, single neuron activity, and network properties via distinct mechanisms.

Measurements
Soma Surface :  49.89 μm2
Number of Stems :  24
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  82
Overall Width :  20.95 μm
Overall Height :  106.03 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  355.48 μm
Total Surface :  335.03 μm2
Total Volume :  25.13 μm3
Max Euclidean Distance :  110.7 μm
Max Path Distance :  117.52 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  613
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  38.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.07°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website