8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07110
Cell Name :  AWab101608cell1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-MADM
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  AWab101608cell1.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory, frontal or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Depolarizing effect of neocortical chandelier neurons.

Measurements
Soma Surface :  491.37 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  35
Overall Width :  383.04 μm
Overall Height :  702.96 μm
Overall Depth :  22.29 μm
Average Diameter :  0.24 μm
Total Length :  2370.62 μm
Total Surface :  1717.22 μm2
Total Volume :  218.1 μm3
Max Euclidean Distance :  553.16 μm
Max Path Distance :  918.88 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  3969
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  91.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.82°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website