8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07106
Cell Name :  AWab042309cell2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-MADM
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  AWab042309cell2.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory, frontal or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Depolarizing effect of neocortical chandelier neurons.

Measurements
Soma Surface :  469.42 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  52
Number of Branches :  108
Overall Width :  612.56 μm
Overall Height :  933.86 μm
Overall Depth :  123.3 μm
Average Diameter :  0.12 μm
Total Length :  7119.89 μm
Total Surface :  2806.56 μm2
Total Volume :  93.22 μm3
Max Euclidean Distance :  953.88 μm
Max Path Distance :  1313.86 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  15469
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  75.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.33°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website