8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283067
Cell Name :  AT_3W_46lif_Series004
Archive Name :  Jin
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-YFP+ApoE-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  18 grams
Max Weight :  18 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Apo E Knockout
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  20  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2024-04-29
Date of Upload :  2024-05-24
Persistence Vector :  AT_3W_46lif_Series004.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Astroglial exosome HepaCAM signaling and ApoE antagonization coordinates early postnatal cortical pyramidal neuronal axon growth and dendritic spine formation.

Measurements
Soma Surface :  1553.99 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  26
Overall Width :  171.22 μm
Overall Height :  169.31 μm
Overall Depth :  18.91 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1134.58 μm
Total Surface :  3564.4 μm2
Total Volume :  891.1 μm3
Max Euclidean Distance :  108.68 μm
Max Path Distance :  137.8 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  4238
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  21.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.02°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website