8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_250043
Cell Name :  AR3_Ly_IBA1_S3_2
Archive Name :  Garcia-Hernandez_DeSantis
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  lysolecithin injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x , 40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-11-02
Date of Upload :  2022-12-07
Persistence Vector :  AR3_Ly_IBA1_S3_2.pvec
Note :  Demyelination was achieved by injecting 1 microliter of saline and lysolecithin at a concentration of 1% in the dorsal hippocampus.

Reference Article
Related Article Reference :  Mapping microglia and astrocyte activation in vivo using diffusion MRI.

Measurements
Soma Surface :  124.75 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  24
Overall Width :  38.07 μm
Overall Height :  21.68 μm
Overall Depth :  7.88 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  176.5 μm
Total Surface :  138.62 μm2
Total Volume :  8.66 μm3
Max Euclidean Distance :  22.86 μm
Max Path Distance :  28.9 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  107
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  118.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.35°
Fractal Dimension :  1.07

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