8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_250051
Cell Name :  AR1_Ly_IBAQ1_S5_1
Archive Name :  Garcia-Hernandez_DeSantis
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  lysolecithin injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x , 40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-11-02
Date of Upload :  2022-12-07
Persistence Vector :  AR1_Ly_IBAQ1_S5_1.pvec
Note :  Demyelination was achieved by injecting 1 microliter of saline and lysolecithin at a concentration of 1% in the dorsal hippocampus.

Reference Article
Related Article Reference :  Mapping microglia and astrocyte activation in vivo using diffusion MRI.

Measurements
Soma Surface :  136.72 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  55
Overall Width :  50.37 μm
Overall Height :  32.4 μm
Overall Depth :  20.03 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  384.63 μm
Total Surface :  302.09 μm2
Total Volume :  18.88 μm3
Max Euclidean Distance :  33.53 μm
Max Path Distance :  53.4 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  296
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  94.8°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.15°
Fractal Dimension :  1.09

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website