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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102247
Cell Name :  APPKO-set3-006
Archive Name :  Southam
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.5 days
Max Age :  15.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Microtubule-associated protein 2 (MAP2)-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  APP Knockout
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-07-31
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  APPKO-set3-006.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Knockout of Amyloid beta Protein Precursor (APP) Expression Alters Synaptogenesis, Neurite Branching and Axonal Morphology of Hippocampal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  1215.51 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  58
Overall Width :  266.07 μm
Overall Height :  325.96 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.35 μm
Total Length :  2751.78 μm
Total Surface :  2991.16 μm2
Total Volume :  258.74 μm3
Max Euclidean Distance :  213.36 μm
Max Path Distance :  298.64 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1418
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  54.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.82°
Fractal Dimension :  1.01

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