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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102239
Cell Name :  APPKO-set2-006
Archive Name :  Southam
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.5 days
Max Age :  15.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Microtubule-associated protein 2 (MAP2)-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  APP Knockout
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-07-31
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  APPKO-set2-006.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Knockout of Amyloid beta Protein Precursor (APP) Expression Alters Synaptogenesis, Neurite Branching and Axonal Morphology of Hippocampal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  747.68 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  56
Overall Width :  132.07 μm
Overall Height :  188.56 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.35 μm
Total Length :  1412.09 μm
Total Surface :  1534.93 μm2
Total Volume :  132.77 μm3
Max Euclidean Distance :  123.27 μm
Max Path Distance :  159.64 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  733
Partition Asymmetry :  0.3
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  61.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.02°
Fractal Dimension :  1.01

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