8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117823
Cell Name :  AP61-S1-4_Cell-1
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP61-S1-4_Cell-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  204.16 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  23
Overall Width :  33.22 μm
Overall Height :  30.36 μm
Overall Depth :  5.56 μm
Average Diameter :  0.49 μm
Total Length :  301.71 μm
Total Surface :  444.33 μm2
Total Volume :  59.34 μm3
Max Euclidean Distance :  29.4 μm
Max Path Distance :  58.29 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.63
Total Fragmentation :  440
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.88
Average Bifurcation Angle Local :  72.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.73°
Fractal Dimension :  1.22

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website