8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117815
Cell Name :  AP49-S4-3_Cell-2
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic + URMC-099
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP49-S4-3_Cell-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  572.65 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  17
Overall Width :  47.56 μm
Overall Height :  31.32 μm
Overall Depth :  7.68 μm
Average Diameter :  0.45 μm
Total Length :  312.67 μm
Total Surface :  437.27 μm2
Total Volume :  56.51 μm3
Max Euclidean Distance :  31.29 μm
Max Path Distance :  63.33 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.55
Total Fragmentation :  433
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.85
Average Bifurcation Angle Local :  83.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.18°
Fractal Dimension :  1.25

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website