8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117795
Cell Name :  AP49-S2-1_Cell-1
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic + URMC-099
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP49-S2-1_Cell-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  180.63 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  11
Overall Width :  33.62 μm
Overall Height :  28.38 μm
Overall Depth :  7 μm
Average Diameter :  0.46 μm
Total Length :  230.03 μm
Total Surface :  343.6 μm2
Total Volume :  49.73 μm3
Max Euclidean Distance :  22.66 μm
Max Path Distance :  45.25 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.51
Total Fragmentation :  313
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.72
Average Bifurcation Angle Local :  105.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.99°
Fractal Dimension :  1.27

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website