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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117827
Cell Name :  AP47-S2-5_Cell-3
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP47-S2-5_Cell-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  44.37 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  7
Overall Width :  8.53 μm
Overall Height :  18.14 μm
Overall Depth :  3.3 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  66.49 μm
Total Surface :  114.16 μm2
Total Volume :  18.13 μm3
Max Euclidean Distance :  15.44 μm
Max Path Distance :  33.05 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.55
Total Fragmentation :  88
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2.31
Average Bifurcation Angle Local :  52.56°
Average Bifurcation Angle Remote :  35.29°
Fractal Dimension :  1.33

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