8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117865
Cell Name :  AP47-S1-3_Cell-1
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP47-S1-3_Cell-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  162.84 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  14
Overall Width :  43.96 μm
Overall Height :  31.81 μm
Overall Depth :  8.42 μm
Average Diameter :  0.43 μm
Total Length :  223.92 μm
Total Surface :  291.28 μm2
Total Volume :  36.49 μm3
Max Euclidean Distance :  34.41 μm
Max Path Distance :  67.62 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.62
Total Fragmentation :  341
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2.79
Average Bifurcation Angle Local :  84.83°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.8°
Fractal Dimension :  1.18

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