8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117860
Cell Name :  AP45-S4-3_Cell-2
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP45-S4-3_Cell-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  116.84 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  34.45 μm
Overall Height :  9.44 μm
Overall Depth :  5.58 μm
Average Diameter :  0.43 μm
Total Length :  112.75 μm
Total Surface :  147.14 μm2
Total Volume :  18.2 μm3
Max Euclidean Distance :  21.01 μm
Max Path Distance :  50.32 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.61
Total Fragmentation :  147
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  89.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.02°
Fractal Dimension :  1.28

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website