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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117881
Cell Name :  AP45-S1-2_Cell-2
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP45-S1-2_Cell-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  157.84 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  6
Overall Width :  5.92 μm
Overall Height :  27.22 μm
Overall Depth :  13.15 μm
Average Diameter :  0.49 μm
Total Length :  90.4 μm
Total Surface :  144.69 μm2
Total Volume :  20.33 μm3
Max Euclidean Distance :  15.56 μm
Max Path Distance :  32.89 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.54
Total Fragmentation :  116
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.46
Average Bifurcation Angle Local :  55.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.31°
Fractal Dimension :  1.38

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