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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117751
Cell Name :  AP41-A1-S1-5_1
Archive Name :  Kiyota_Machhi
Species Name :  mouse
Strain :  APP/PS1
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  double-transgenic + URMC-099
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-09-28
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AP41-A1-S1-5_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  URMC-099 facilitates amyloid-beta clearance in a murine model of Alzheimer's disease.

Measurements
Soma Surface :  214.61 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  19
Overall Width :  51.32 μm
Overall Height :  21.55 μm
Overall Depth :  7.01 μm
Average Diameter :  0.48 μm
Total Length :  296.98 μm
Total Surface :  461.99 μm2
Total Volume :  71.68 μm3
Max Euclidean Distance :  36.4 μm
Max Path Distance :  86.44 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.57
Total Fragmentation :  398
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  3.64
Average Bifurcation Angle Local :  97.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.29°
Fractal Dimension :  1.25

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