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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35191
Cell Name :  AM-T1B
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-T1B.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  1871.5 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  37
Overall Width :  183.03 μm
Overall Height :  374.93 μm
Overall Depth :  139.6 μm
Average Diameter :  1.29 μm
Total Length :  1976.98 μm
Total Surface :  8677.38 μm2
Total Volume :  4338.11 μm3
Max Euclidean Distance :  307.93 μm
Max Path Distance :  400.37 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  464
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.3
Average Bifurcation Angle Local :  67.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.33°
Fractal Dimension :  1.02

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