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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35245
Cell Name :  AM-S1A
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-S1A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2321.78 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  56
Overall Width :  147.5 μm
Overall Height :  576.23 μm
Overall Depth :  112.65 μm
Average Diameter :  1.2 μm
Total Length :  3210.14 μm
Total Surface :  12836.1 μm2
Total Volume :  5402.47 μm3
Max Euclidean Distance :  396.48 μm
Max Path Distance :  432.99 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  718
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  1.33
Average Bifurcation Angle Local :  63.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.61°
Fractal Dimension :  1.02

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