8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35218
Cell Name :  AM-R1C
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-R1C.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  1974.9 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  41
Overall Width :  195.73 μm
Overall Height :  361.79 μm
Overall Depth :  96.15 μm
Average Diameter :  1.29 μm
Total Length :  2572.1 μm
Total Surface :  10823.6 μm2
Total Volume :  4527.01 μm3
Max Euclidean Distance :  220.98 μm
Max Path Distance :  274.85 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  686
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  1.37
Average Bifurcation Angle Local :  87.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.65°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website