8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35239
Cell Name :  AM-Q2A
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-Q2A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2160.42 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  58
Overall Width :  197.57 μm
Overall Height :  588.66 μm
Overall Depth :  126.87 μm
Average Diameter :  1.39 μm
Total Length :  3266.38 μm
Total Surface :  15106.2 μm2
Total Volume :  7668.32 μm3
Max Euclidean Distance :  516.56 μm
Max Path Distance :  597.88 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  799
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.35
Average Bifurcation Angle Local :  71.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.55°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website