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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35177
Cell Name :  AM-H3A
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-H3A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  1880.01 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  50
Overall Width :  200.55 μm
Overall Height :  488.24 μm
Overall Depth :  118.2 μm
Average Diameter :  1.34 μm
Total Length :  2943.81 μm
Total Surface :  13012.2 μm2
Total Volume :  7085.64 μm3
Max Euclidean Distance :  417.49 μm
Max Path Distance :  474.24 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  626
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.32
Average Bifurcation Angle Local :  67.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.15°
Fractal Dimension :  1.02

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