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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35176
Cell Name :  AM-H2C
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-H2C.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  1989.83 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  29
Overall Width :  97.12 μm
Overall Height :  204.34 μm
Overall Depth :  86.95 μm
Average Diameter :  1.58 μm
Total Length :  1080.63 μm
Total Surface :  5765.25 μm2
Total Volume :  3384.71 μm3
Max Euclidean Distance :  131.55 μm
Max Path Distance :  146.31 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  250
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.21
Average Bifurcation Angle Local :  82.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.69°
Fractal Dimension :  1.03

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