8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35157
Cell Name :  AM-D2
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-D2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2037.67 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  29
Overall Width :  77.18 μm
Overall Height :  189.86 μm
Overall Depth :  93.81 μm
Average Diameter :  1.02 μm
Total Length :  1234.76 μm
Total Surface :  4020.63 μm2
Total Volume :  1445.24 μm3
Max Euclidean Distance :  148.6 μm
Max Path Distance :  184.72 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  298
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.37
Average Bifurcation Angle Local :  67.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.9°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website